Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP35Q9P2H5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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