Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms