Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms