Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms