Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1Q9HCU9 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1Q9HCU9 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms