Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNTNAP3Q9BZ76 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms