Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM4-202ENST00000374181 7275 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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