Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms