Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms