Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms