Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms