Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TREX2Q9BQ50 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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