Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms