Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms