Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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ZNF397Q8NF99 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ZNF397Q8NF99 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ZNF397Q8NF99 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ZNF397Q8NF99 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ZNF397Q8NF99 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ZNF397Q8NF99 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ZNF397Q8NF99 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ZNF397Q8NF99 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ZNF397Q8NF99 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ZNF397Q8NF99 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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