Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms