Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC091078.1-202ENST00000543286 2012 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 LINC02170-202ENST00000562231 2218 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms