Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms