Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms