Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms