Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NCAPHQ15003 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NCAPHQ15003 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NCAPHQ15003 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NCAPHQ15003 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NCAPHQ15003 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NCAPHQ15003 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NCAPHQ15003 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NCAPHQ15003 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NCAPHQ15003 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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