Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CBFBQ13951 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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