Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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