Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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