Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE3BQ13370 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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