Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNH2Q12809 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms