Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 DPM1-201ENST00000371582 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL359918.2-201ENST00000412311 497 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC103982.1-201ENST00000561358 571 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL050343.1-203ENST00000586761 1290 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 GSTA2-201ENST00000493422 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms