Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms