Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 EIF3C-209ENST00000566501 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX1P83916 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX1P83916 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX1P83916 DCLRE1C-210ENST00000378289 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX1P83916 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX1P83916 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX1P83916 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX1P83916 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX1P83916 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX1P83916 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX1P83916 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX1P83916 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX1P83916 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX1P83916 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 TMEM220-201ENST00000341871 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX1P83916 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 STRA6-201ENST00000323940 2864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms