Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JAG1P78504 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JAG1P78504 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 347 ms