Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBG1P69891 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms