Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms