Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms