Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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