Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CRIP1P50238 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms