Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MAP1LC3BP1-202ENST00000438342 516 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC022784.6-203ENST00000520255 863 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AP001180.4-201ENST00000584167 823 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PNLIPRP2-201ENST00000579578 1482 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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