Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms