Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP8P40818 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP8P40818 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP8P40818 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms