Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms