Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA10P31260 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms