Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIG1P18858 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIG1P18858 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms