Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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