Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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BRAFP15056 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BRAFP15056 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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