Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DMDP11532 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DMDP11532 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms