Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLUP10909 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CLUP10909 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CLUP10909 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CLUP10909 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CLUP10909 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLUP10909 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
CLUP10909 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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