Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-2B6SEH9 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms