Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GGTLC3B5MD39 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms