Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SOBPA7XYQ1 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SOBPA7XYQ1 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SOBPA7XYQ1 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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