Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAPPC8Q9Y2L5 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms