Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00474Q9P2X8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms